Champs · découverte en boucle fermée · modèle ↔ laboratoire humide

Sciences du vivant

Dynamique des protéines, découverte biologique et raisonnement sur des décennies de preuves publiées.

Une prédiction sans validation, c’est de la publication, pas de la science. Nos partenaires réalisent les essais. Des mesures réelles alimentent l’itération suivante.

dynamique des protéines raisonnement sur la littérature découverte en boucle fermée
Notre manière de travailler

Les modèles rejoignent les laboratoires humides

Notre travail en sciences du vivant repose sur la conviction qu’une prédiction sans validation, c’est de la publication, pas de la science. Nous associons les modèles à des partenaires expérimentaux qui valident, contestent et réinjectent des mesures réelles dans l’itération suivante — et nous ancrons chaque affirmation dans des preuves de la littérature auxquelles l’équipe peut se fier.

prédiction seule de la publication, pas de la science
prédiction + validation une science sur laquelle l’itération suivante peut bâtir
Trois axes de travail

Là où la science se fait

L1 Dynamique des protéines

Au-delà de la prédiction de structure statique, vers la dynamique qui gouverne réellement la fonction — et les invariants physiques que nous pouvons compresser.

récompense
des invariants que le système peut exploiter à travers les familles
pénalise
des plongements qui ressemblent au jeu d’entraînement
L2 Raisonnement sur la littérature

Des systèmes de raisonnement qui aident les biologistes à relier des décennies de preuves publiées à l’expérience qu’ils ont devant eux, avec la provenance attachée.

récompense
une provenance attachée à chaque affirmation utilisable par un biologiste
pénalise
un raisonnement qui ne peut pas être retracé jusqu’à un article
L3 Découverte en boucle fermée

Les prédictions sont associées à des partenaires expérimentaux qui valident, contestent et réinjectent des mesures réelles dans l’itération suivante.

récompense
des prédictions qu’un partenaire est prêt à réaliser
pénalise
des prédictions écrites pour le classement
Provenance des preuves

Des décennies de preuves, chaque affirmation traçable.

Chaque ligne est un type de preuve réel indexé par la surface littéraire. La colonne du poids représente la contribution à l’affirmation en cours, et non une note attribuée à l’article.

id année titre type poids
P-2024-AKT 1994 kinase substrate binding under conformational drift primary 0.84
R-2008-FLEX 2008 review · protein-flexibility datasets, 1994–2008 review 0.71
D-2017-MD-LG 2017 long-timescale molecular-dynamics ensemble release dataset 0.78
P-2021-CRYO 2021 cryo-EM evidence for an alternate hinge state primary 0.92
M-2024-MULTI 2024 meta-analysis · ensemble vs static prediction error meta 0.66
C-2025-CTRL 2025 control trial · in-vitro flexibility under mutation partner 0.88
Protocole partenaire

Un transfert de modèle qu’un partenaire de laboratoire humide réalisera.

Pré-enregistré. Intervalles de confiance attachés. Critères de réussite et d’échec convenus avant le lancement de l’expérience.

01
model
predict
predicted ensemble + confidence interval per residue
02
shared
spec
pre-registered assay · success and failure criteria
03
partner
measure
partner runs experiment, returns raw + processed
04
shared
fold-back
measurement enters the next iteration as evidence
01

De la littérature au laboratoire

Nous travaillons avec les biologistes pour donner du sens à des décennies de preuves publiées et les relier à l’expérience qu’ils ont devant eux, avec une provenance à laquelle l’équipe peut se fier.

02

Les modèles rejoignent les laboratoires humides

Les prédictions sont associées à des partenaires expérimentaux qui valident, contestent et réinjectent des mesures réelles dans l’itération suivante.

Des modèles qui rejoignent le laboratoire, pas le classement.