L1 Dinâmica de proteínas
Para além da previsão de estrutura estática, rumo à dinâmica que de facto governa a função — e os invariantes físicos que podemos comprimir.
Ciências da vida
Dinâmica de proteínas, descoberta biológica e raciocínio sobre décadas de evidência publicada.
Previsão sem validação é publicação, não ciência. Os nossos parceiros realizam os ensaios. Medições reais alimentam a iteração seguinte.
dinâmica de proteínas raciocínio sobre a literatura descoberta em ciclo fechado
Como trabalhamos
Os modelos encontram os laboratórios húmidos
O nosso trabalho em ciências da vida assenta na convicção de que previsão sem validação é publicação, não ciência. Emparelhamos modelos com parceiros experimentais que validam, contestam e devolvem medições reais à iteração seguinte — e fundamentamos cada afirmação em evidência da literatura na qual a equipa pode confiar.
apenas previsão → publicação, não ciência
previsão + validação → ciência sobre a qual a iteração seguinte pode construir
Três linhas de trabalho
Onde acontece a ciência
L2 Raciocínio sobre a literatura
Sistemas de raciocínio que ajudam os biólogos a ligar décadas de evidência publicada ao experimento que têm em mãos, com proveniência associada.
L3 Descoberta em ciclo fechado
As previsões são emparelhadas com parceiros experimentais que validam, contestam e devolvem medições reais à iteração seguinte.
Proveniência da evidência
Décadas de evidência, cada afirmação rastreável.
Cada linha é um tipo de evidência real que a superfície da literatura indexa. A coluna de peso é a contribuição para a afirmação em curso, não uma classificação do artigo.
id ano título tipo peso
P-2024-AKT 1994 kinase substrate binding under conformational drift primary 0.84
R-2008-FLEX 2008 review · protein-flexibility datasets, 1994–2008 review 0.71
D-2017-MD-LG 2017 long-timescale molecular-dynamics ensemble release dataset 0.78
P-2021-CRYO 2021 cryo-EM evidence for an alternate hinge state primary 0.92
C-2025-CTRL 2025 control trial · in-vitro flexibility under mutation partner 0.88
Protocolo de parceiro
Uma entrega de modelo que um parceiro de laboratório húmido irá executar.
Pré-registado. Intervalos de confiança associados. Critérios de sucesso e falha acordados antes de o experimento ser realizado.
01
model
predict
predicted ensemble + confidence interval per residue
02
shared
spec
pre-registered assay · success and failure criteria
03
partner
measure
partner runs experiment, returns raw + processed
04
shared
fold-back
measurement enters the next iteration as evidence
Da literatura ao laboratório
Trabalhamos com biólogos para dar sentido a décadas de evidência publicada e ligá-la ao experimento que têm em mãos, com uma proveniência na qual a equipa pode confiar.
Os modelos encontram os laboratórios húmidos
As previsões são emparelhadas com parceiros experimentais que validam, contestam e devolvem medições reais à iteração seguinte.