Felder · Entdeckung im geschlossenen Regelkreis · Modell ↔ Nasslabor

Biowissenschaften

Proteindynamik, biologische Entdeckung und Schlussfolgern auf der Grundlage von Jahrzehnten veröffentlichter Erkenntnisse.

Vorhersage ohne Validierung ist Publizieren, nicht Wissenschaft. Unsere Partner führen die Assays durch. Echte Messungen fließen in die nächste Iteration ein.

Proteindynamik Schlussfolgern aus der Literatur Entdeckung im geschlossenen Regelkreis
Wie wir arbeiten

Modelle treffen auf Nasslabore

Unsere Arbeit in den Biowissenschaften beruht auf der Überzeugung, dass Vorhersage ohne Validierung Publizieren ist, nicht Wissenschaft. Wir koppeln Modelle mit experimentellen Partnern, die validieren, widersprechen und echte Messungen in die nächste Iteration zurückfließen lassen — und wir fundieren jede Aussage in Literaturbelegen, denen das Team vertrauen kann.

nur Vorhersage Publizieren, nicht Wissenschaft
Vorhersage + Validierung Wissenschaft, auf der die nächste Iteration aufbauen kann
Drei Arbeitsfelder

Wo die Wissenschaft stattfindet

L1 Proteindynamik

Über die statische Strukturvorhersage hinaus, hin zur Dynamik, die die Funktion tatsächlich bestimmt — und zu den physikalischen Invarianten, die wir komprimieren können.

belohnt
Invarianten, die das System über Familien hinweg nutzen kann
bestraft
Embeddings, die wie der Trainingssatz aussehen
L2 Schlussfolgern aus der Literatur

Schlussfolgerungssysteme, die Biologinnen und Biologen helfen, Jahrzehnte veröffentlichter Erkenntnisse mit dem Experiment vor ihnen zu verknüpfen — mit beigefügter Provenienz.

belohnt
Provenienz, die jeder Aussage anhaftet und die eine Biologin nutzen kann
bestraft
Schlussfolgern, das sich nicht auf eine Veröffentlichung zurückführen lässt
L3 Entdeckung im geschlossenen Regelkreis

Vorhersagen werden mit experimentellen Partnern gekoppelt, die validieren, widersprechen und echte Messungen in die nächste Iteration zurückfließen lassen.

belohnt
Vorhersagen, die ein Partner bereit ist durchzuführen
bestraft
Vorhersagen, die für die Rangliste geschrieben sind
Beweisprovenienz

Jahrzehnte an Evidenz, jede Aussage rückverfolgbar.

Jede Zeile ist ein realer Evidenztyp, den die Literaturoberfläche indexiert. Die Gewichtsspalte ist der Beitrag zur laufenden Aussage, keine Bewertung der Veröffentlichung.

ID Jahr Titel Art Gewicht
P-2024-AKT 1994 kinase substrate binding under conformational drift primary 0.84
R-2008-FLEX 2008 review · protein-flexibility datasets, 1994–2008 review 0.71
D-2017-MD-LG 2017 long-timescale molecular-dynamics ensemble release dataset 0.78
P-2021-CRYO 2021 cryo-EM evidence for an alternate hinge state primary 0.92
M-2024-MULTI 2024 meta-analysis · ensemble vs static prediction error meta 0.66
C-2025-CTRL 2025 control trial · in-vitro flexibility under mutation partner 0.88
Partnerprotokoll

Eine Modellübergabe, die ein Nasslabor-Partner durchführen wird.

Vorregistriert. Konfidenzintervalle beigefügt. Erfolgs- und Misserfolgskriterien vereinbart, bevor das Experiment durchgeführt wird.

01
model
predict
predicted ensemble + confidence interval per residue
02
shared
spec
pre-registered assay · success and failure criteria
03
partner
measure
partner runs experiment, returns raw + processed
04
shared
fold-back
measurement enters the next iteration as evidence
01

Von der Literatur zum Labor

Wir arbeiten mit Biologinnen und Biologen daran, Jahrzehnte veröffentlichter Erkenntnisse zu erschließen und sie mit dem Experiment vor ihnen zu verknüpfen — mit einer Provenienz, der das Team vertrauen kann.

02

Modelle treffen auf Nasslabore

Vorhersagen werden mit experimentellen Partnern gekoppelt, die validieren, widersprechen und echte Messungen in die nächste Iteration zurückfließen lassen.

Modelle, die dem Labor begegnen, nicht der Rangliste.