E1 組み合わせ可能な構成要素
パイプラインは、バージョン管理された宣言的なコンポーネントから組み立てられ、その依存関係とともに移動します。
Emmy
科学的ドメインを横断して、再現可能な研究パイプラインを実行するワークスペース・オーケストレーターです。
研究とともに移動するワークスペース・オーケストレーター。パイプラインは、実行・リプレイ・監査のいずれにおいても同一の結果を生みます。
構成要素 ソース · 変換 · 評価 · レポート
リプレイ 構造的に決定論的
ドメイン 生物学 · 材料 · 認知
Emmy とは
研究とともに移動するオーケストレーション
Emmy は、科学研究をドメインを横断して再現可能に保つために私たちが使用するオーケストレーションツールです。研究の構成要素を、実行・リプレイ・監査が可能なパイプラインへと組み立て、データのバージョン管理と依存関係管理を、それを使う科学者に可視化します。これは、結果をノートブックから弁護可能なアーティファクトへと移行させるための層です。
Emmy の構成
三つの特性
E2 構造的に再現可能
リプレイは決定論的です。パイプラインを再実行すると、入力が変わらない限り同じアーティファクトが得られ、変わった場合はその変化が可視化されます。
E3 ドメイン非依存
Emmy は、ドメインフレームワークになることなく、生物学・材料・認知の各分野で使用されます。これはモデリングではなく、ワークフローです。
リプレイログ
5回のリプレイ。一つのハッシュ。
入力が一致する限り、同じパイプラインは毎回同じアーティファクトを生成します。入力が変われば、その変化は行レベルで可視化されます。
実行 タイムスタンプ 出力ハッシュ 一致
run #1 2026-04-12 09:14 sha256:5c0a…b71e 同一
run #2 2026-04-14 22:38 sha256:5c0a…b71e 同一
run #3 2026-04-22 11:02 sha256:5c0a…b71e 同一
run #4 2026-05-03 16:50 sha256:5c0a…b71e 同一
run #5 2026-05-19 07:22 sha256:5c0a…b71e 同一
構成要素
4種類を組み合わせ、あらゆるものを構築。
01
ソース
バージョン管理された入力——ハッシュで固定されたデータ、モデル、またはアーティファクト。
02
変換
入力から出力への決定論的な変換。
03
評価
固定されたスイートに対して採点され、出力にはトレースが含まれます。
04
レポート
実行に固定された最終アーティファクト。エンドツーエンドでリプレイ可能。
私たちが活用するドメイン
一つのオーケストレーター、三つの科学分野。
BIO
生物学
配列パイプライン、構造予測、バージョン管理された参照を備えた多段階分析。
MAT
材料
シリコンフローの実行、アナログブロックのスイープ、プロセスを横断して再現性を保つレイアウトからLVSへのパイプライン。
COG
認知
マルチシード実行を含む、認知基盤研究のためのトレーニングおよび評価パイプライン。
私たちが構築した理由
研究のスピードは、再現性のためのインフラがボトルネックになっています。Emmy はその答えです。すなわち、科学者がパイプラインを共同研究者に引き継いでも、同じ答えが返ってくるようにするワークスペース・オーケストレーターです。